文久三年倒幕派击败了佐幕派刀剑的时代宣告结束―――幕末时代作为刀剑男士的堀川国广和曾经一同被主人用作战斗武器的和泉守兼定奔跑在雨中的山路刀剑男士在审神者的激励下开启了付丧神的道路他们的使命是将企图改变历史的时间溯行军打倒以守护正确的历史与陆奥守吉行药研藤四郎蜻蛉切鹤丸国永这些新的伙伴一起在动荡的时代投身到与时间溯行军的战斗中刀刃挥舞刀光剑影刀剑男士即刻出阵
