在火星发现的神秘箱子――潘多拉魔盒打开的瞬间巨大的墙壁突然出现故事由此开始被称为天空之墙的墙壁把日本列岛分割为三部分并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」其中在东都有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境挡在Smash面前而出现的是一位青年其腰上戴着腰带手上握着不可思议的瓶子「变身」――青年天才物理学者变身为假面骑士Build阻挡在Smash的面前
