曾经有一场被称作厄祭战的大型战争那场战争终结后过了大约300年地球圈失去了至今为止的统治机构在新的支配体系下新世界被构筑起来一时的和平到来与此同时远离地球的火星圈燃起了新战争的火种主人公少年三日月奥古斯从所属的民间警备公司克律塞安保公司下称CGS那里接受了打算让在地球势力统治下的火星都市独立的少女库德莉亚蓝那伯恩斯坦的护卫任务但CGS受到摘取反叛之芽的武力组织加拉尔霍恩的袭击于是在把三日月这些孩子当做诱饵后撤退了少年们的领袖奥尔加伊兹卡认为这是个机会并决定对虐待自己的大人们掀起反旗被奥尔加托付击退加拉尔霍恩的三日月利用被当做CGS动力炉来使用的厄祭战时代的机动战士高达巴巴托斯向敌军发起挑战
