将施奈德回老家之后，四只原本亲如兄弟的神龟由于没有了敌人，于是不再想以往一样一起战斗，而是各自在喜欢的领域内钻研，以往一起行动的忍者神龟们变成了四个独来独往的“独行侠”！
这时，纽约市中发生一连窜的怪事。原来实业家马克西米林安•J•威特斯意图征服纽约市，秘密培养了一支远古怪兽组成的军队，加上恶名昭彰的忍者组织Foot Clan，各种黑暗势力又在城市的角落里蠢蠢欲动！
神龟们又处于备战状态了！他们再次联合起来，准备向黑暗势力出击！
9.0
入野自由,早见沙织,小原好美,阿座上洋平
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8.0
前野智昭,菲鲁兹·蓝,稗田宁宁,富田美忧,关俊彦,小野贤章,上田瞳,诹访部顺一,赤羽根健治,四宫豪,江口拓也,大久保瑠美,鸟海浩辅,皆口裕子,竹内良太,大西沙织,山根绮,逢田梨香子,河西健吾,白石稔,石田彰
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6.0
花守由美里,土屋神叶,内田真礼,朴璐美,樱井孝宏,小西克幸,松田洋治,飞田展男,能登麻美子,水濑祈,泽城美雪,石谷春贵,濑户芭月
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1.0
内田雄马,户谷菊之介
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8.0
仁见纱绫,大冢刚央,中谷一博,飞田展男,上田燿司
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7.0
中山真奈花,前田佳织里,关根明良,大地叶,筱原侑,上坂堇,中村栞奈,若井友希,井口裕香,橘杏咲,长谷川玲奈,仁见纱绫,伊藤彩沙,寺泽百花,明坂聪美,弘松芹香,冲佳苗,花咲心优,大森日雅,朝日奈丸佳,武田罗梨沙多胡,菲鲁兹·蓝,三日尻望,伊濑茉莉也,井上麻里奈,小坂井祐莉绘,井泽诗织,林梨花,藤寺美德,石井未纱,日高范子,小西克幸,稻田彻
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